ESIEE Paris · กำลังหาการฝึกงานวิจัย 6 เดือน · NLP ทางคลินิก & AI ชีวการแพทย์ · ตั้งแต่ ก.พ. 2027

สกัดไบโอมาร์กเกอร์จากข้อความทางคลินิก โดยไม่ต้องปลุก GPU

ผมคือ Clément Longeac ผมสร้าง DEMNE เฟรมเวิร์กการกำหนดเส้นทางที่เลือกวิธีที่เบาที่สุดซึ่งยังคงเชื่อถือได้สำหรับเอนทิตีแต่ละประเภท ได้แก่ กฎเกณฑ์ transformer หรือ LLM บนคอฮอร์ต AP-HP ที่ไม่เคยเห็นมาก่อน มันกำหนดเส้นทาง 99.5% ของการกล่าวถึงไปยังกฎที่ตรวจสอบได้ด้วย F1 0.941 ขณะที่ transformer ที่ปรับละเอียดทำได้เพียง 0.358

DEMNE routing decision graph: entity metrics route to RULES, TBM or LLM
DEMNE — Rules → Transformer → LLM แผนผังแบบสด

จากติวเตอร์คณิตศาสตร์สู่การสร้างแบบจำลองตัวบ่งชี้มะเร็ง

ผมเป็นนักศึกษาชั้นปีที่ 4 ที่ ESIEE Paris สาขา Data Science & AI และอยู่ในหลักสูตร Tremplin Recherche ของโรงเรียน — โปรแกรมที่ออกแบบมาสำหรับนักศึกษาที่มุ่งสู่งานวิจัยระดับปริญญาเอกแทนที่จะเป็นการฝึกงานในอุตสาหกรรมทั่วไป

งานของผมเน้นการทำให้ข้อความทางคลินิกที่ไม่มีโครงสร้างสามารถนำไปใช้ในงานวิจัยได้: การสกัดตัวบ่งชี้ทางชีวภาพ ข้อมูลระยะของโรค และรายละเอียดการรักษาที่ฝังอยู่ในรายงานมะเร็งวิทยาภาษาฝรั่งเศส ซึ่งเครื่องมือ NLP ทั่วไปมักล้มเหลวอย่างต่อเนื่องเมื่อเจอคำศัพท์เฉพาะทางและโครงสร้างเอกสารของสาขานี้

นอกจากการเรียน ผมยังสอนพิเศษวิชาคณิตศาสตร์และฟิสิกส์-เคมีผ่าน Complétude และกำลังเตรียมสมัครทุนปริญญาเอกภาคอุตสาหกรรม CIFRE ด้าน AI ชีวการแพทย์ที่มหาวิทยาลัยซอร์บอนน์

ในระยะยาว วินัยแบบเดียวกันนี้ — การดึงโครงสร้างที่เชื่อถือได้ออกจากข้อความที่ยุ่งเหยิงและมีความเสี่ยงสูง — คือสิ่งที่ดึงดูดผมเข้าสู่งานวิจัยด้านความปลอดภัยของ AI: การสร้างและประเมิน world model ผ่าน AMI Labs และโปรแกรม Anthropic Fellows (นี่คือข้อความร่าง — โปรดแทนที่ด้วยถ้อยคำฉบับสมบูรณ์ของคุณเอง)

Clément Longeac
สถาบัน
ESIEE Paris
หลักสูตร
Data Science & AI (DSIA)
แทร็ก
Tremplin Recherche
ขั้นตอนถัดไป
ปริญญาเอก AI ชีวการแพทย์ — ซอร์บอนน์
ภาษา
FR · EN · JP · ES

DEMNE

ไปป์ไลน์การรู้จำเอนทิตีที่มีชื่อแบบไฮบริดสำหรับข้อความทางคลินิกด้านมะเร็งวิทยาภาษาฝรั่งเศส

สิ่งที่แนวทางแบบขั้นตอนมอบให้

0.0%

of mentions routed to rules (unseen AP-HP cohort, 411/413)

0.000

rule F1 vs 0.358 for a fine-tuned DrBERT

0.000

leave-one-corpus-out routing concordance

Determination of Extraction Methods for Named Entities

NER ทางคลินิก · คลังข้อมูลมะเร็งวิทยาภาษาฝรั่งเศส

โมเดล NER สำเร็จรูปมักล้มเหลวอย่างหนักกับข้อความทางคลินิกภาษาฝรั่งเศส: คำย่อที่หนาแน่น รูปแบบที่ไม่สอดคล้องกันระหว่างระบบโรงพยาบาล และคำศัพท์ตัวบ่งชี้ทางชีวภาพที่แทบไม่ปรากฏในข้อมูลฝึกฝนทั่วไป DEMNE แก้ปัญหานี้ด้วยไปป์ไลน์แบบขั้นตอนแทนที่จะใช้โมเดลเดียว — แต่ละขั้นตอนจัดการสิ่งที่มันทำได้ดีที่สุด และจะยกระดับไปยังโมเดลที่หนักกว่าเมื่อจำเป็นเท่านั้น

ระบบนี้ปรับแต่ง DrBERT-7GB บนคลังข้อมูลมะเร็งวิทยาภาษาฝรั่งเศสสามชุดที่แตกต่างกัน และมุ่งเป้าไปที่เอนทิตีตัวบ่งชี้ทางชีวภาพเจ็ดประเภทสำคัญที่ใช้ในรายงานที่เกี่ยวข้องกับการรักษา

NLP ทางคลินิกTransformerDrBERT-7GBมะเร็งวิทยาฝรั่งเศส
01

ขั้นตอนที่ใช้กฎเกณฑ์

การจับคู่ด้วย regex และพจนานุกรมช่วยดักจับเอนทิตีที่มีความเชื่อมั่นสูงและความกำกวมต่ำด้วยต้นทุนต่ำ เช่น วันที่ ขนาดยา คำย่อมาตรฐานของตัวบ่งชี้ทางชีวภาพ

02

การสกัดด้วย Transformer

DrBERT-7GB ที่ปรับแต่งบนคลังข้อมูลมะเร็งวิทยาสามชุด จัดการกับเอนทิตีที่ต้องการความเข้าใจเชิงความหมายและโดเมนอย่างแท้จริง

03

การตัดสินด้วย LLM

ข้อขัดแย้งที่เหลือและกรณีชายขอบจะถูกส่งไปยังขั้นตอน LLM เพื่อขจัดความกำกวมขั้นสุดท้ายก่อนส่งออกผลลัพธ์

ความสอดคล้องด้านกฎระเบียบ — EU AI Act

การสกัดเอนทิตีทางคลินิกจากเวชระเบียนผู้ป่วยจัดอยู่ในหมวดความเสี่ยงสูงของ EU AI Act อย่างชัดเจน การออกแบบแบบขั้นตอนของ DEMNE คำนึงถึงมาตรา 12 และ 14 ตั้งแต่ต้น ไม่ใช่เพิ่มเข้ามาภายหลัง

มาตรา 12 — การเก็บบันทึก

ทุกการตัดสินใจในการสกัดข้อมูลสามารถตรวจสอบย้อนกลับไปยังขั้นตอน (กฎเกณฑ์, Transformer หรือ LLM) และคะแนนความเชื่อมั่นที่สร้างมันขึ้นมา ทำให้สามารถบันทึกข้อมูลตรวจสอบได้โดยอัตโนมัติ

มาตรา 14 — การกำกับดูแลโดยมนุษย์

ผลลัพธ์จากการตัดสินของ LLM จะถูกทำเครื่องหมายเพื่อให้แพทย์ตรวจสอบ แทนที่จะยอมรับโดยเงียบๆ ทำให้มนุษย์ยังคงมีบทบาทในกรณีที่กำกวม

สถานที่ที่งานได้ดำเนินมาจนถึงตอนนี้

พ.ค. – ก.ค. 2026

นักวิจัยฝึกงาน, คลังข้อมูลคลินิก

AP-HP (Assistance Publique – Hôpitaux de Paris)

ประยุกต์และตรวจสอบแนวทางการกำหนดเส้นทางของ DEMNE บนข้อมูลโรงพยาบาล: สกัดตัวบ่งชี้ทางชีวภาพด้านมะเร็ง (ER, PR, HER2, Ki67, FISH) จากรายงานคลินิกภาษาฝรั่งเศส และกำหนดเส้นทางทางคลินิกที่ตรวจสอบย้อนหลังได้และสมจริงต่อการนำไปใช้งาน

Clinical NLPEDS-NLPBRAT / CoNLLPythonDrBERT
ต.ค. 2025 – พ.ค. 2026

นักวิจัยนักศึกษา, Tremplin Recherche

ESIEE Paris · LBA (Aix-Marseille) · AP-HP

ออกแบบ DEMNE ไปป์ไลน์ NER ทางคลินิกแบบผสม (กฎ / transformer / LLM) สำหรับข้อความมะเร็งวิทยาภาษาฝรั่งเศส ขับเคลื่อนด้วยห้าเมตริกคลังข้อมูลที่ถูกจัดรูปแบบอย่างเป็นทางการ — โครงการหลักของเส้นทาง Tremplin Recherche ก่อนการสมัครปริญญาเอก

PythonHugging FaceDrBERTpycrfsuiteeco2aiBRAT / CoNLLOptuna
2026 – ปัจจุบันกำลังดำเนินการ

Product Lead และนักพัฒนา, NeuroStep

Junior Entreprise ESIEE Paris

สร้างแพลตฟอร์มที่ให้ผู้ป่วยบาดเจ็บทางสมองและนักกิจกรรมบำบัดเปรียบเทียบเครื่องมือชดเชยการรู้คิดได้อย่างเป็นระบบ เริ่มต้นเป็นต้นแบบ Python/Streamlit ที่แฮกกาธอน SN@SU (Sorbonne Université ร่วมกับ Flor Sanchez-Luizard นักกิจกรรมบำบัดที่ UEROS L’ADAPT Île-de-France) ขณะนี้กำลังกำหนดขอบเขตการสร้างใหม่ระดับโปรดักชัน (FastAPI, PostgreSQL, Next.js) ด้วยโฮสติงที่สอดคล้องกับ HDS/GDPR และเครื่องมือค้นหาเชิงความหมายสำหรับการจับคู่เครื่องมือทางคลินิก

PythonStreamlitFastAPIPostgreSQLNext.js
2024 – 2027

นักศึกษาวิศวกรรม — วิทยาการข้อมูลและ AI

ESIEE Paris

นักศึกษาชั้นปีที่ห้าของหลักสูตรวิศวกรรมห้าปีที่ ESIEE Paris เชี่ยวชาญด้านวิทยาการข้อมูลและ AI (DSIA)

Machine LearningDeep LearningData ScienceC / C++
2025

วิศวกรฝึกงาน, ฝ่าย GRADES

Synchrotron SOLEIL

พัฒนา autopkgtest ด้วย OpenCL เพื่อตรวจสอบความเข้ากันได้ของ GPU AMD (pyopencl, nabu, ufo-filters, pyvkfft) บนโครงสร้างพื้นฐาน Debian/ROCm บน GitLab Salsa

OpenCLPythonBashDebianGitLab CIROCm
2022 – ปัจจุบัน

ติวเตอร์สายวิทย์-คณิต

Complétude

สอนคณิตศาสตร์และฟิสิกส์-เคมีแก่นักเรียนราวสิบคน ตั้งแต่ระดับประถมจนถึงชั้นมัธยมปลายปีสุดท้าย ควบคู่กับการเรียนวิศวกรรม

MathematicsPhysicsPedagogy

ผลงานเด่น

นอกเหนือจาก DEMNE — เครื่องมือที่สร้างขึ้นตั้งแต่ต้นจนจบสำหรับแฮกกาธอนและงานในรายวิชา

NeuroStep
มิถุนายน 2026 · แฮกกาธอน SN@SU

NeuroStep

แคตตาล็อกเครื่องมือชดเชยการรู้คิดแบบดิจิทัลสำหรับผู้ที่มีการบาดเจ็บทางสมองและนักกิจกรรมบำบัดของพวกเขา

PythonStreamlitFastAPIPostgreSQL
Learn more →
Air Quality Dashboard
ธ.ค. 2025 · โปรเจกต์ทีม

Air Quality Dashboard

แดชบอร์ดเชิงโต้ตอบที่สร้างภาพมลพิษทางอากาศพื้นหลัง 15 ปีทั่วฝรั่งเศสขึ้นใหม่ (2000–2015)

PythonSQLitePlotlyLeafletpandas
Learn more →
Face Recognition with Deep Learning
2025 · โปรเจกต์รายวิชา

Face Recognition with Deep Learning

การรู้จำใบหน้าด้วย CNN บนภาพนิ่งแล้วจึงเป็นวิดีโอ โดยใช้การเพิ่มข้อมูลและการจัดแนวใบหน้า

PythonTensorFlowCNNData augmentation
Learn more →
TBA — Text Adventure Game
2025 · โปรเจกต์คู่

TBA — Text Adventure Game

เกมผจญภัยแบบข้อความบนเทอร์มินัลที่เขียนด้วย Python ด้วยการออกแบบเชิงวัตถุ

PythonOOP
Learn more →
Marmiton Data Intelligence
ก.พ. 2025 · โปรเจกต์ทีม

Marmiton Data Intelligence

แพลตฟอร์มวิเคราะห์ข้อมูลด้านอาหาร: การสแครป, ETL และแดชบอร์ดบนข้อมูลสูตรอาหาร

PythonScrapingETLJupyter
Learn more →
Debian ROCm CI
2025 · Synchrotron SOLEIL

Debian ROCm CI

สคริปต์ autopkgtest ที่ตรวจสอบซอฟต์แวร์วิทยาศาสตร์บน GPU ของ AMD บนโครงสร้างพื้นฐาน CI ของ Debian

OpenCLROCmautopkgtestsbuildDebianGitLab Salsa
Learn more →

เทคโนโลยีที่ใช้

เครื่องมือที่จัดกลุ่มตามความเกี่ยวข้องกับงานข้างต้น — ไม่ใช่รายการทั่วไป

NLP ทางคลินิกและ AI ชีวการแพทย์

DrBERT-7GB · CamemBERT · spaCy · HuggingFace Transformers
Regex/lexicon design · Optuna (NSGA-II) · BRAT / CoNLL
Clinical text preprocessing · Domain adaptation

ระบบและโครงสร้างพื้นฐาน

Python · FastAPI · PostgreSQL · Docker · Kubernetes
Linux · Debian · GitLab CI · GitHub Actions
OpenCL · pyopencl · ROCm · CUDA (basic)

เครื่องมือวิจัย

PyTorch · LaTeX/Overleaf · TikZ · Zotero
Jupyter · pandas · NumPy · matplotlib

ภาษา

🇫🇷 ภาษาแม่ · 🇬🇧 C1 · 🇯🇵 ระดับกลาง · 🇪🇸 B2 · 🇮🇹 กำลังเรียนรู้

จุดเน้นการวิจัย

I

การรู้จำเอนทิตีที่มีชื่อทางคลินิก

การสกัดไบโอมาร์กเกอร์ ระยะของโรค และข้อมูลการรักษาจากข้อความมะเร็งวิทยาภาษาฝรั่งเศสที่ไม่มีโครงสร้าง — จุดที่ NLP ทั่วไปล้มเหลวและการปรับตัวเฉพาะโดเมนเริ่มต้นขึ้น

II

AI แบบประหยัดและตีความได้

ออกแบบระบบที่นำทางไปยังระดับที่โปร่งใสน้อยที่สุดเท่าที่ยังตรงตามเกณฑ์ประสิทธิภาพ การปฏิบัติตาม EU AI Act ในฐานะข้อจำกัดด้านการออกแบบ ไม่ใช่ความคิดภายหลัง

III

การให้เหตุผลทางชีวการแพทย์แบบหลายรูปแบบ

ทิศทางระยะยาว: การรวมข้อความทางคลินิก ภาพถ่ายทางการแพทย์ และจีโนมิกส์เข้าด้วยกันในโมเดลที่ให้เหตุผลข้ามรูปแบบข้อมูล — แนวทาง world models ที่ประยุกต์ใช้กับการแพทย์

IV

การสอนระบบที่ซับซ้อน

สอนคณิตศาสตร์และฟิสิกส์-เคมีให้นักเรียนประมาณสิบคนที่ Complétude ตั้งแต่ระดับประถมศึกษาจนถึงมัธยมปลายปีสุดท้าย (ไม่รวมระดับอุดมศึกษา) การทำให้แนวคิดที่ซับซ้อนเรียนรู้ได้คือทักษะการวิจัย ไม่ใช่งานเสริม

มาคุยกันเรื่อง NLP ทางคลินิก, AI ชีวการแพทย์ หรือความร่วมมือด้านปริญญาเอกกันเถอะ

นัดหมายการโทร →
ติดต่อโดยตรง
ที่อื่น