ESIEE Paris · 6 महीने की शोध इंटर्नशिप की तलाश · क्लिनिकल NLP और बायोमेडिकल AI · फ़रवरी 2027 से

क्लिनिकल टेक्स्ट से बायोमार्कर निकालना, बिना GPU जगाए ।

मैं Clément Longeac हूँ। मैं DEMNE बनाता हूँ, एक रूटिंग फ्रेमवर्क जो हर एंटिटी प्रकार के लिए सबसे हल्की पर विश्वसनीय विधि चुनता है — नियम, एक ट्रांसफॉर्मर, या एक LLM। एक अनदेखी AP-HP कोहॉर्ट पर यह 99.5% उल्लेखों को ऑडिट-योग्य नियमों की ओर भेजता है, F1 0.941 के साथ, जबकि फाइन-ट्यून किया ट्रांसफॉर्मर केवल 0.358 तक पहुँचता है।

DEMNE routing decision graph: entity metrics route to RULES, TBM or LLM
DEMNE — Rules → Transformer → LLM, लाइव योजनाबद्ध चित्र

गणित पढ़ाने से ट्यूमर मार्करों के मॉडलिंग तक

मैं ESIEE Paris में चौथे वर्ष का छात्र हूँ, डेटा साइंस और एआई में विशेषज्ञता के साथ, और स्कूल के Tremplin Recherche ट्रैक में नामांकित हूँ — यह कार्यक्रम मानक इंडस्ट्री इंटर्नशिप के बजाय डॉक्टरेट शोध की ओर बढ़ रहे छात्रों के लिए बनाया गया है।

मेरा काम असंरचित क्लिनिकल टेक्स्ट को शोध के लिए उपयोगी बनाने पर केंद्रित है: फ्रेंच ऑन्कोलॉजी रिपोर्टों में छिपे बायोमार्कर, स्टेजिंग जानकारी और उपचार विवरण निकालना, जहाँ सामान्य-उद्देश्य वाले एनएलपी उपकरण डोमेन-विशिष्ट शब्दावली और दस्तावेज़ संरचना के सामने लगातार विफल होते हैं।

अपनी पढ़ाई के साथ-साथ मैं Complétude के माध्यम से गणित और भौतिकी-रसायन विज्ञान पढ़ाता हूँ, और सोरबोन विश्वविद्यालय में बायोमेडिकल एआई में CIFRE औद्योगिक पीएचडी के लिए आवेदन तैयार कर रहा हूँ।

दीर्घकालिक रूप से, यही अनुशासन — अव्यवस्थित, उच्च-जोखिम वाले टेक्स्ट से विश्वसनीय संरचना निकालना — मुझे एआई सुरक्षा अनुसंधान की ओर आकर्षित करता है: AMI Labs और Anthropic Fellows कार्यक्रम के माध्यम से world model बनाना और उनका मूल्यांकन करना। (यह एक मसौदा पंक्ति है — इसे अपने अंतिम शब्दों से बदलें।)

Clément Longeac
संस्थान
ESIEE Paris
कार्यक्रम
डेटा साइंस एवं एआई (DSIA)
ट्रैक
Tremplin Recherche
अगला कदम
पीएचडी, बायोमेडिकल एआई — सोरबोन
भाषाएँ
FR · EN · JP · ES

DEMNE

फ्रेंच ऑन्कोलॉजी क्लिनिकल टेक्स्ट के लिए एक हाइब्रिड नेम्ड-एंटिटी-रिकग्निशन पाइपलाइन।

चरणबद्ध दृष्टिकोण से क्या मिलता है

0.0%

of mentions routed to rules (unseen AP-HP cohort, 411/413)

0.000

rule F1 vs 0.358 for a fine-tuned DrBERT

0.000

leave-one-corpus-out routing concordance

Determination of Extraction Methods for Named Entities

क्लिनिकल एनईआर · फ्रेंच ऑन्कोलॉजी कॉर्पस

रेडीमेड एनईआर मॉडल फ्रेंच क्लिनिकल टेक्स्ट पर बुरी तरह विफल होते हैं: घने संक्षिप्ताक्षर, अस्पताल प्रणालियों के बीच असंगत फॉर्मेटिंग, और बायोमार्कर शब्दावली जो सामान्य प्रशिक्षण डेटा में मुश्किल से दिखाई देती है। DEMNE इसे एक ही मॉडल के बजाय एक चरणबद्ध पाइपलाइन से हल करता है — हर चरण वही करता है जो उसमें सबसे अच्छा होता है, और आवश्यकता पड़ने पर ही भारी मॉडल की ओर बढ़ता है।

यह सिस्टम तीन अलग-अलग फ्रेंच ऑन्कोलॉजी कॉर्पस पर DrBERT-7GB को फाइन-ट्यून करता है, और उपचार-संबंधी रिपोर्टिंग में इस्तेमाल होने वाले सात प्राथमिकता वाले बायोमार्कर एंटिटी प्रकारों को लक्षित करता है।

क्लिनिकल एनएलपीट्रांसफॉर्मरDrBERT-7GBफ्रेंच ऑन्कोलॉजी
01

नियम-आधारित चरण

रेगेक्स और लेक्सिकॉन मिलान कम लागत पर उच्च-विश्वास, कम-अस्पष्टता वाली एंटिटीज़ को पकड़ता है — तारीखें, खुराकें, मानक बायोमार्कर संक्षिप्ताक्षर।

02

ट्रांसफॉर्मर एक्सट्रैक्शन

तीन ऑन्कोलॉजी कॉर्पस पर फाइन-ट्यून किया गया DrBERT-7GB उन एंटिटीज़ को संभालता है जिन्हें वास्तविक अर्थगत और डोमेन समझ की आवश्यकता होती है।

03

एलएलएम मध्यस्थता

शेष टकरावों और सीमांत मामलों को आउटपुट से पहले अंतिम अस्पष्टता निवारण के लिए एलएलएम चरण में भेजा जाता है।

नियामक अनुपालन — EU AI Act

रोगी रिकॉर्ड पर क्लिनिकल एंटिटी एक्सट्रैक्शन स्पष्ट रूप से EU AI Act की उच्च-जोखिम श्रेणी में आता है। DEMNE का चरणबद्ध डिज़ाइन शुरुआत से ही अनुच्छेद 12 और 14 को ध्यान में रखता है, बाद में जोड़े गए उपाय के रूप में नहीं।

अनुच्छेद 12 — रिकॉर्ड-कीपिंग

हर एक्सट्रैक्शन निर्णय उस चरण (नियम, ट्रांसफॉर्मर, या एलएलएम) और विश्वास स्कोर तक ट्रेस किया जा सकता है जिसने उसे उत्पन्न किया, जिससे स्वचालित ऑडिट लॉगिंग संभव होती है।

अनुच्छेद 14 — मानव निगरानी

एलएलएम मध्यस्थता के आउटपुट को चुपचाप स्वीकार करने के बजाय क्लिनिशियन समीक्षा के लिए फ्लैग किया जाता है, जिससे अस्पष्ट मामलों में मानव की भूमिका बनी रहती है।

अब तक काम कहाँ हुआ है

मई – जुल. 2026

शोध प्रशिक्षु, क्लिनिकल डेटा वेयरहाउस

AP-HP (Assistance Publique – Hôpitaux de Paris)

अस्पताल डेटा पर DEMNE के रूटिंग दृष्टिकोण को लागू और सत्यापित किया: फ़्रेंच क्लिनिकल रिपोर्टों से ऑन्कोलॉजी बायोमार्कर (ER, PR, HER2, Ki67, FISH) निकालना, और एक ऑडिट-योग्य, परिनियोजन-यथार्थ क्लिनिकल पथ परिभाषित करना।

Clinical NLPEDS-NLPBRAT / CoNLLPythonDrBERT
अक्तू. 2025 – मई 2026

छात्र शोधकर्ता, Tremplin Recherche

ESIEE Paris · LBA (Aix-Marseille) · AP-HP

फ़्रेंच ऑन्कोलॉजी टेक्स्ट के लिए एक हाइब्रिड क्लिनिकल NER पाइपलाइन (नियम / transformer / LLM), DEMNE, डिज़ाइन की — पाँच औपचारिक कॉर्पस मेट्रिक्स से संचालित; PhD आवेदनों से पहले Tremplin Recherche मार्ग की केंद्रीय परियोजना।

PythonHugging FaceDrBERTpycrfsuiteeco2aiBRAT / CoNLLOptuna
2026 – वर्तमानजारी

प्रोडक्ट लीड व डेवलपर, NeuroStep

Junior Entreprise ESIEE Paris

एक प्लेटफ़ॉर्म का निर्माण जो मस्तिष्क-चोट के मरीज़ों और व्यावसायिक चिकित्सकों को संज्ञानात्मक-क्षतिपूर्ति उपकरणों की तुलना का संरचित तरीका देता है। SN@SU हैकाथॉन में Python/Streamlit प्रोटोटाइप के रूप में शुरू हुआ (Sorbonne Université, UEROS L’ADAPT Île-de-France की व्यावसायिक चिकित्सक Flor Sanchez-Luizard के साथ); अब HDS/GDPR-अनुरूप होस्टिंग और क्लिनिकल टूल मिलान हेतु सिमेंटिक सर्च इंजन के साथ उत्पादन-स्तरीय पुनर्निर्माण (FastAPI, PostgreSQL, Next.js) की रूपरेखा बन रही है।

PythonStreamlitFastAPIPostgreSQLNext.js
2024 – 2027

इंजीनियरिंग छात्र — डेटा साइंस व AI

ESIEE Paris

ESIEE Paris के पाँच-वर्षीय इंजीनियरिंग कार्यक्रम का पाँचवें वर्ष का छात्र, डेटा साइंस व AI (DSIA) में विशेषज्ञता।

Machine LearningDeep LearningData ScienceC / C++
2025

इंजीनियरिंग प्रशिक्षु, GRADES प्रभाग

Synchrotron SOLEIL

AMD GPU संगतता (pyopencl, nabu, ufo-filters, pyvkfft) की जाँच हेतु OpenCL से autopkgtests विकसित किए, GitLab Salsa पर Debian/ROCm अवसंरचना में।

OpenCLPythonBashDebianGitLab CIROCm
2022 – वर्तमान

विज्ञान-गणित ट्यूटर

Complétude

इंजीनियरिंग पढ़ाई के साथ-साथ प्राथमिक से बारहवीं तक के लगभग दस छात्रों को गणित और भौतिकी-रसायन पढ़ाना।

MathematicsPhysicsPedagogy

चुनिंदा प्रोजेक्ट

DEMNE के अलावा — एक हैकाथॉन और कोर्सवर्क के लिए शुरू से अंत तक बनाए गए टूल्स।

NeuroStep
जून 2026 · SN@SU हैकाथॉन

NeuroStep

मस्तिष्क चोट से ग्रस्त लोगों और उनके व्यावसायिक चिकित्सकों के लिए डिजिटल संज्ञानात्मक-क्षतिपूर्ति उपकरणों की सूची।

PythonStreamlitFastAPIPostgreSQL
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Air Quality Dashboard
दिस. 2025 · टीम प्रोजेक्ट

Air Quality Dashboard

फ़्रांस में 15 वर्षों के पृष्ठभूमि वायु प्रदूषण को पुनर्निर्मित करने वाला एक इंटरैक्टिव डैशबोर्ड (2000–2015)।

PythonSQLitePlotlyLeafletpandas
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Face Recognition with Deep Learning
2025 · कोर्स प्रोजेक्ट

Face Recognition with Deep Learning

स्थिर छवियों और फिर वीडियो पर CNN-आधारित चेहरा पहचान, डेटा ऑगमेंटेशन और फ़ेस अलाइनमेंट के साथ।

PythonTensorFlowCNNData augmentation
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TBA — Text Adventure Game
2025 · जोड़ी प्रोजेक्ट

TBA — Text Adventure Game

ऑब्जेक्ट-ओरिएंटेड डिज़ाइन के साथ, टर्मिनल में खेली जाने वाली Python की टेक्स्ट एडवेंचर गेम।

PythonOOP
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Marmiton Data Intelligence
फ़र. 2025 · टीम प्रोजेक्ट

Marmiton Data Intelligence

एक पाककला डेटा-एनालिटिक्स प्लेटफ़ॉर्म: स्क्रैपिंग, ETL और रेसिपी डेटा पर एक डैशबोर्ड।

PythonScrapingETLJupyter
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Debian ROCm CI
2025 · Synchrotron SOLEIL

Debian ROCm CI

Debian की CI अवसंरचना पर, AMD GPU पर वैज्ञानिक सॉफ़्टवेयर को सत्यापित करने वाले autopkgtest स्क्रिप्ट।

OpenCLROCmautopkgtestsbuildDebianGitLab Salsa
Learn more →

तकनीकी स्टैक

ऊपर के काम से प्रासंगिकता के अनुसार समूहीकृत टूल्स — कोई सामान्य सूची नहीं।

क्लिनिकल एनएलपी और बायोमेडिकल एआई

DrBERT-7GB · CamemBERT · spaCy · HuggingFace Transformers
Regex/lexicon design · Optuna (NSGA-II) · BRAT / CoNLL
Clinical text preprocessing · Domain adaptation

सिस्टम और इंफ्रास्ट्रक्चर

Python · FastAPI · PostgreSQL · Docker · Kubernetes
Linux · Debian · GitLab CI · GitHub Actions
OpenCL · pyopencl · ROCm · CUDA (basic)

शोध उपकरण

PyTorch · LaTeX/Overleaf · TikZ · Zotero
Jupyter · pandas · NumPy · matplotlib

भाषाएं

🇫🇷 मातृभाषा · 🇬🇧 C1 · 🇯🇵 मध्यम · 🇪🇸 B2 · 🇮🇹 सीखने की प्रक्रिया में

फ़ोकस क्षेत्र

I

क्लिनिकल नेम्ड एंटिटी रिकग्निशन

असंरचित फ्रेंच ऑन्कोलॉजी टेक्स्ट से बायोमार्कर, स्टेजिंग और उपचार डेटा निकालना — वह बिंदु जहां सामान्य-प्रयोजन एनएलपी विफल होता है और डोमेन अनुकूलन शुरू होता है।

II

किफायती और व्याख्या-योग्य एआई

ऐसे सिस्टम डिज़ाइन करना जो प्रदर्शन सीमा को पूरा करने वाले सबसे कम अपारदर्शी स्तर की ओर रूट करते हैं। EU AI Act का अनुपालन एक डिज़ाइन बाधा के रूप में, न कि बाद में सोचे गए विचार के रूप में।

III

मल्टीमॉडल बायोमेडिकल रीज़निंग

दीर्घकालिक दिशा: क्लिनिकल टेक्स्ट, इमेजिंग और जीनोमिक्स को ऐसे मॉडलों में एकीकृत करना जो मोडैलिटी के पार तर्क करते हैं — चिकित्सा पर लागू वर्ल्ड-मॉडल्स दिशा।

IV

जटिल प्रणालियों की शिक्षाशास्त्र

Complétude में लगभग दस छात्रों को गणित और भौतिकी-रसायन शास्त्र पढ़ाना, प्राथमिक से लेकर बारहवीं कक्षा तक (उच्च शिक्षा को छोड़कर)। सघन अवधारणाओं को सीखने योग्य बनाना एक शोध कौशल है, कोई साइड-गिग नहीं।

आइए क्लिनिकल एनएलपी, बायोमेडिकल एआई, या पीएचडी सहयोग पर बात करें।

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